Ročníkový projekt 2018/19
Meno: Andrej Korman
Email: korman6@uniba.sk
Vedúci projektu: doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD.
Email vedúceho: tomas.vinar@fmph.uniba.sk
Názov projektu: NADAR: NAnopore DAta Reader
Ciele projektu: Vybudovanie nástrojov na uľahčenie spracovania informácií z MinION
(portable real-time device for DNA and RNA sequencing)
Kód: Repozitár na Githube
Práca počas zimného semestra:
- Zoznámenie sa s formou uloženia dát zo sekvenovania
- Zoznámenie sa s dostupnou knižnicou na porovnávanie jednotlivých sekvencií s referenciou
- Zoznámenie sa s výpočtovým klastrom
- Vytvorenie nástroja na vyhľadávanie referenčnej sekvencie
- Prediskutovanie výhrad s vedúcim projektu a aplikovanie týchto zmien
Práca počas letného semestra:
- Refactoring kódu
- Zjednodušenie používania
- Oprava skrytých chýb
Report