Ročníkový projekt 2018/19

Meno: Andrej Korman
Email: korman6@uniba.sk
Vedúci projektu: doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD.
Email vedúceho: tomas.vinar@fmph.uniba.sk
Názov projektu: NADAR: NAnopore DAta Reader
Ciele projektu: Vybudovanie nástrojov na uľahčenie spracovania informácií z MinION (portable real-time device for DNA and RNA sequencing)

Kód: Repozitár na Githube

Práca počas zimného semestra:
  1. Zoznámenie sa s formou uloženia dát zo sekvenovania
  2. Zoznámenie sa s dostupnou knižnicou na porovnávanie jednotlivých sekvencií s referenciou
  3. Zoznámenie sa s výpočtovým klastrom
  4. Vytvorenie nástroja na vyhľadávanie referenčnej sekvencie
  5. Prediskutovanie výhrad s vedúcim projektu a aplikovanie týchto zmien

Práca počas letného semestra:
  1. Refactoring kódu
  2. Zjednodušenie používania
  3. Oprava skrytých chýb

Report